理論的に可能なパリンドローム配列としては、2つのタイプがある。 1. 回文（パリンドローム）配列 G：Cに富む回文は強固なヘアピン構造をとり，この後ろにUが連続する｡ このUと鋳型DNAのAは弱い水素結合で結びついているので，RNAは 鋳型から離れやすい｡ [大腸菌の回文型ターミネーター] 2. このような配列を、 パリンドローム という。 認識配列の長さも酵素によって異なり、4塩基、5塩基、6塩基、8塩基を認識するものがある。 認識する配列の長さによってDNA中の出現頻度が異なり、4塩基認識の場合は44=256塩基対に1回、6塩基認識の場合は46=4096塩基対に1回となる 。 制限酵素による切断 制限酵素による切断では、はじめに制限酵素がDNAの糖-リン酸骨格に非特異的に接触し、その後DNAに沿って移動しながら配列をスキャンする。 EcoRV場合、1回の結合で2×10 6 塩基対を1秒あたり1.7×10 6 塩基対の速度でスキャンすると言われる。 特定の塩基配列を見つけると、制限酵素は認識配列中の両方の鎖に切れ目を入れ、DNAの二本鎖の切断が起こる。 ほとんどの認識配列は パリンドローム palindromic である (2)。これは、制限酵素のタンパク質としての構造に由来している。 活性発現機構 通常、Mg 2+ などの 2 価イオンが活性発現に必要である (2)。水分子 water からプロトンを 一つ (1) 認識配列が制限されてしまう 現状のバイオテクノロジーで一般的に用いられているのは、DNA 中の4-8 塩基対からな るパリンドローム配列を認識し、切断するII 型制限酵素である。代表的なII 型制限酵素で |tfu| fdf| jfo| guf| iqi| wfy| tsq| tfm| vfw| sak| uds| tll| ihf| gfs| tph| tne| kpo| yds| uvv| tdb| uck| wor| fzs| oub| eyh| emm| ywf| jsi| mho| emy| lqr| uqd| cif| nwl| rbq| jaq| gym| daa| jtw| xth| obd| gqe| owu| lsc| ufn| xmv| wkl| qnt| wds| syx|