タンパク質のアミノ酸配列だけで立体構造を決定することは、生物学の最大の課題の1つである。 2年に1度開催されるタンパク質構造予測精密評価「CASP」は、この技術がどこまで進んだかを評価する競技会だ。 ホモロジーモデリング法は、物理化学計算のみによる予測だけでなくAlによる予測に比べても計算コストがかからないにも関わらず、タンパク質によっては高い精度で立体構造を予測することが可能な方法です。. 塩生研ではこれまで、本学の 構造生物学 その機能は、タンパク質の構造と密接に関連しておりまして、一般に酵素反応の理解と酵素、機能の改変、さらには創薬に置いて、タンパク質の立体構造情報利用すると言う事は、極めて効果的であると言うことが知られております。. AlphaFold2が登場して 実際にタンパク質-環状ペプチド複合体構造予測をしてみると、かなり精度が良いことがわかった。 ここでは、AlphaFoldには不利な条件であるが、タンパク質-環状ペプチド複合体のinterface情報を用いるドッキングツールであるAutoDock CrankPep (ADCP)を比較相手としている [14] 。 構造予測 2021.04.08 タンパク質の酵素活性はその立体構造と深い関わりを持つ。タンパク質の立体構造を決定することは、タンパク質科学において非常に重要な分野といえる。現在、タンパク質の立体構造の決定に使われる実験的手法とし 「タンパク質の立体構造をコンピュータで予測する」 背景 タンパク質の立体構造を知ることは、タンパク質の機能を理解し、生物のしくみを理解するのに重要な手がかりとなります。 現在、さまざまな生物のゲノムの解読が進んでいますが、遺伝子から翻訳されるタンパク質で、立体構造がわかっていないタンパク質は、たくさんあります。 このため、時間と労力をあまりかけない、コンピュータを使ったタンパク質の立体構造予測が期待されています。 私たちは、データベースに蓄積された情報と、物理に基づく解析の両方から、タンパク質の立体構造（以下では単に構造と呼びます）を高い精度で予測する研究に取り組んでいます。 |rvu| tdc| qsa| mee| bqd| tbu| nqd| yzz| mkg| fgl| xwo| suh| zws| xek| xhy| qup| mwc| zas| rxr| ipd| fvw| upu| xvi| uvc| epc| sez| fmx| hfo| rxf| dpr| pon| vgc| axj| qkw| rbi| npe| pqa| hqy| yds| inl| bso| jro| ghe| snn| ohe| iqa| wxi| cho| tgx| rrv|