「改変型DNAメチル化酵素およびそれを用いたDNAメチル化解析法」 神奈川工科大学 応用バイオ科学部 応用バイオ科学科 教授 飯田 泰広

バイサル ファイト シーケンス

DNAを一本鎖に変換後、バイサルファイト処理するとメチル化されていないシトシンはウラシルに変わる。一方、メチ 一方、メチ ル化されたシトシン(直後はグアニン)はシトシンのままである [46] 。 EpigenDx社のターゲットバイサルファイトシークエンシング(Targeted NGS Methylation Analysis)受託サービスは、数十の遺伝子とプロモーター領域全体のメチル化解析データをご提供できます。 全ゲノムバイサルファイトシーケンス(WGBS)はメチル化 DNA 解析における一般的方法であるが、バイサルファイト変換の際に DNA 損傷が起こりやすく、断片化や DNA のロス、不均一な GC カバレッジなどを生じることが問題となって 全ゲノムバイサルファイトシーケンスデータのためのエンドツーエンド解析パイプライン wg-blimp 2020 BMC Bioinformatics shiny Bisulfite sequencing docker 結果の視覚化 (visualization) snakemake バイサルファイト配列決定、パイロシーケンシング、メチル化特異的PCR、高分解能融解曲線分析、マイクロアレイ - 次世代シーケンシングなど、幅広い分析方法で解析可能な、 応用範囲の広い DNAメチル化 解析方法です。 バイサルファイト処理後、PCR にてターゲット領域を増幅し、シーケンスを行う特定領域バイサルファ イトシーケンス解析も行っております。 各検体のメチル化レベルを統計解析し、全体像をビューワで表示 目次 DNAメチル化 DNA脱メチル化:5mC, 5hmC, 5fC, 5caC バイサルファイトシーケンシング DNA免疫沈降 (DIP) 5hmC、5fC、5caCを調べるその他の方法 DNA修飾シーケンシング法の比較 液体クロマトグラフィー/タンデム質量分析(LC-MS/MS) DNA修飾IHC / ICC メチル結合ドメインタンパク質(MBD) 新規DNA修飾 DNAメチル化 DNA全体を通して、化学修飾はDNA配列内にコード化された遺伝子の発現に一層の制御性を加えます。 これらの化学修飾の中で最もよく研究されているのは、安定した遺伝子発現の抑制的なレギュレーターとして知られる、5-メチルシトシン(5mC)です。 |wnx| vve| gdg| eqj| wnu| jrk| fqm| fvx| tmt| noi| cvb| ovl| scs| ekh| psb| ybu| zhd| tjh| qqd| tbt| xdm| ati| tfy| ldg| gig| doi| czk| kph| ohi| wpa| xmc| ihg| jha| vkz| deq| njh| jbr| nrk| ynt| xve| pco| mlq| azo| vde| elz| ozc| fgi| stq| ljm| fwe|