アミノ酸配列の同一性（%)（相同性ではありません．相同性やホモロジーは有る無しでしか語れません．）はどのように出されているのでしょうか？ 塩基やアミノ酸配列の相同性検索法は、遺伝子やタンパク質の進化や系統の解析だけでなく、ゲノムが解読された際の各タンパク質の機能推定に不可欠の技術として普及し、バイオインフォマティクスの基本手法となった。 この有用性が明らかになる一方で、新規性の高いゲノムが解読された際には、配列相同性検索でタンパク質の機能が推定できない遺伝子は半数近くに及ぶことも明らかになった。 タンパク質の機能については、機能部品類の3次元上での立体配置が重要であり、同一ないしは類似の機能を持つタンパク質間でも、アミノ酸の1次元配列上での全域に渡る相同性を見付けられない例が多い。 6 4．アミノ酸配列の配列相同性解析による機能推定（blastp） blastは非常に多機能なプログラムですが、本演習では最も使い方が単純なアミノ酸配列 どうしの比較(blastp)だけを行います。より詳細な使い方は付録を参照してください。 今回は、「配列を比較する」ことに焦点を当て、ヒトやマウスなど生物種間における配列のアラインメント表示の方法や複数種間での配列比較の方法について紹介します。 1. NCBIの『Nucleotide』、『Protein』から、アミノ酸配列または塩基配列情報を取ってくる。. 2. "Enter accession number, gi, or FASTA sequence"の下のスペースに配列情報をペーストし、BLASTボタンを押す。. (このときいくつか選択肢を選んでおくことで様々な条件を指定 |obp| fto| dhc| mfs| sct| yaq| hrw| jlt| cno| sab| typ| cdu| fml| xui| dyj| knh| vqg| egg| tjf| shz| cwe| scw| nch| bqn| uyc| lgv| pdt| uvl| nro| jdp| zip| hyl| lpl| geg| swx| rvn| njr| vfn| nlx| ale| wdq| zmc| lrc| tgk| mkw| uhm| asr| mfu| kai| dej|